A primeira tentativa de criar uma segunda divisão no Amador Sanjoanense foi em 1954, a novidade na época não teve continuidade, pois em 1955, não houve campeonatos, por falta de campos para realizar as partidas.
A segunda divisão no amador só teve início em 2001, mas até o amador de 2005, as equipes que escolhiam a divisão que iriam disputar. A partir do Campeonato da Amizade de 2005, e até 2011, havia uma seletiva inicial com todas as equipes inscritas, onde conforme a classificação em seus grupos, classificava as equipes para as disputas das Taças Ouro (primeira divisão), Prata (segunda divisão) e Bronze (terceira divisão), sendo que a Taça Bronze houve até o Campeonato Amador de 2008.
Entre os anos de 2012 até 2016, havia o acesso e descenso entre as divisões (do Amador para o Amizade no mesmo ano e do Amizade para o Amador do ano seguinte).
Em 2017 e 2018, o Campeonato foi disputado em Turnos (1º e 2º turnos), e o acesso era para os Campeões de cada turno apenas no ano seguinte.
A partir de 2019, voltou-se o acesso e descenso entre as divisões para o campeonato seguinte (do Primeiro Semestre para o Segundo Semestre no mesmo ano e do Segundo Semestre para o Primeiro Semestre do ano seguinte).
Em 2020, não houve campeonato por causa da Pandemia do Covid-19. Em 2021, houve apenas um campeonato no ano, onde não houve o acesso ou descenso.
Em 2022, com o fim da Pandemia, voltou-se novamente o acesso e descenso entre as divisões para o campeonato seguinte.

DADOS POR EQUIPE